Ga naar artikel

J(S)mol

Bron: brouw-bier.nl - Alles wat de amateur bierbrouwer of bierliefhebber moet weten over het brouwen van bier bierliefhebber moet weten over het brouwen van bier Op verschillende pagina's op deze website worden moleculen in 3D getoond. Hiervoor wordt Jmol gebruikt. Jmol is een visualisatieprogramma in de chemie en biochemie om molecuulstructuren te kunnen weergeven. Deze afbeeldingen zijn interactief te bekijken. Met behulp van de muis kan je ze op allerlei manieren bekijken. Een aantal voorbeelden zijn hieronder weergegeven.

Effect Actie
Menu Rechter muisklik, of
Ctrl + Linker muisklik
Roteren in X en Y richting Linker muisknop ingedrukt houden en muis bewegen
Verplaatsen in X, Y richting Ctrl + rechter muisknop ingedrukt houden en muis bewegen
Roteren in Z richting Shift + rechter muisknop ingedrukt houden en muis bewegen
(alleen horizontaal)
Vergroten/Verkleinen Shift + linker muisknop ingedrukt houden en muis vertikaal bewegen
Oorspronkelijke afbeelding Shift + dubbelklik linker muisknop op de achtergrond

Voorbeeld

Op deze afbeelding van het aminozuur Cysteïne, kan je bovenstaande acties proberen.

Kleuren

Zoals in je in het bovenstaande afbeelding ziet, worden de atomen in verschillende kleuren weergegeven. Hieronder zie je een tabel met de meest voorkomende atomen met hun kleuren.

Kleur Atoom
grijs C koolstof
rood O zuurstof
wit H waterstof
blauw N stikstof
oranje P fosfor
geel S zwavel

Door de muis op een molecuul te plaatsen, krijg je ook information over het desbetreffende atoom te zien.

Voor meer informatie, kijk op: